Jana Brotánková vystudovala fyziku na Matematicko-fyzikální fakultě UK a svou odbornou dráhu zahájila na Ústavu fyziky plazmatu AV ČR, kde pracovala na tokamaku CASTOR v rámci široké mezinárodní spolupráce. Po několikaletém působení v zahraničí (Indie, Austrálie) se vrátila do Česka a založila PlasmaLab@CTU – laboratoř pro výuku diagnostiky plazmatu a fúze na FJFI ČVUT.
Na fakultě se podílí na výuce termojaderné fúze, působí v předsednictvu mezinárodní vzdělávací sítě FuseNet a od roku 2023 je předsedkyní České fyzikální společnosti. Dlouhodobě se věnuje také popularizaci vědy a vzdělávání nové generace fyziků a fyziček.